鄢文豪赴德国洪堡大学交流访问纪实
应德国柏林洪堡大学Kerstin Kaufmann教授邀请,我于2019年8月23日至2019年9月2日赴德国进行学术交流访问。访问期间与Kerstin Kaufmann教授课题组以及德国国家分子医学中心(Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin ,MDC)Sascha Sauer课题组就作物调控组学以及单细胞生物学相关研究技术体系进行了深入的探讨,为未来在我校建立高标准的调控组学和单细胞生物学平台打下坚实基础。具体的细节如下:
2019年8月23日
8月23日清早,我第一次乘坐曹操专车到底机场,一路上交通通畅。连日来的会议不曾休息,身体颇有些疲惫。从武汉飞往巴黎的飞机上,一直在撰写申请材料,不停的修修改改,直到感到全身发冷才意识到已经过去了七个多小时。法航的空调温度开得太低了,这也直接导致我接下来的十天在感冒中度过。到巴黎顺利入关,转机,两小时之后柏林也是轻车熟路,没有任何耽搁,与柏林当地时间晚上八点半顺利抵达柏林泰戈尔机场。老朋友陈迪俊博士早在出口等候。迪俊也是华农校友,更是我德国几年博士后研究工作更好的合作者和朋友。一路回到波茨坦,我生活了六年的城市。这次访问之所以住在波茨坦,主要是因为波茨坦城市小,宾馆住宿相对于柏林要便宜不少。波茨坦离柏林距离较近,即便住宿费加上交通费也比住在柏林便宜。来到golm村的家庭旅馆时已经是九点多,因为恰逢周末又是自助性质的家庭旅馆,拿钥匙,入住都是自助的(这也是比较便宜的原因),结束所有的手续已经是深夜了。
2019年8月24日
第一天时差反应是难免的,也不知道是什么时候入睡的,但是醒来很早。一醒来就心里咯噔,完了,鼻塞,头晕,嗓子肿痛,果然是航班太冷吹感冒了。起床吃了经典的旅馆德式早餐,面包、黄油加奶酪。谈不上喜欢但也不讨厌,毕竟吃过好几年,但是一想到后面十天每天要吃这个,还是有些怀念包子、油条、热干面。吃完早饭,在附近徒步转了转,希望走累了好睡觉。Golm村一如既往的安宁,那些树、那些房子并没有太多的变化。原本约了Kerstin Kaufmann教授在柏林碰面,她考虑到我时间紧迫还特意答应周末来加个班。结果因为我的重感冒,临时发消息取消了。幸好来德国特意带了之前的手机,可以发whatsapp,要不Kerstin得傻等一天了。趁着超市还开门去买了维生素C和面包、水果,以免明天周日断粮。
2019年8月25日
感冒症状不见好转,反而因为上火嘴巴又破了,说话吃东西都生疼,不禁为接下来一周的交流担心。白天尽可能在旅店休息,实在睡不着就出门走走,好在天气很好,空气清新,倒也没有觉得太难受。期间,好友朱峰博士(华农校友)给我送来了白加黑并给我弄了些吃的。一天大部分时间就在晕晕乎乎中度过,到了晚上吞了黑片但却迟迟无法入睡,尤其是嘴巴的疼痛让人相当不舒服,最后也不知道是什么时候才入睡,但是凌晨三点就醒了便再也睡不着了。挨到凌晨五点,索性起床。吃了两颗白片后打开电脑把要和Kerstin交流的东西整理了一遍。
2019年8月26日
早上八点,准时来到了柏林洪堡大学的罗达-爱德曼楼,这里是Kerstin Kaufmann教授的实验室所在地。该楼的造型本身就是一个细胞的形状,大楼仅有四层,里面入驻着植物RNA生物学,动物数量遗传学,生态学以及植物细胞发育生物学等课题组。Kerstin的实验室在四楼,作为W3主席教授,她的实验室占据了半层楼的面积,共有九个房间,有专们的ChIPLAB和protein IP lab,是调控生物学的专业实验室且规模较大。
Kerstin早就在办公室等候,因为我还是重感冒状态,只能坐的远远的跟她谈话。我们重点谈了关于在小麦中开展组蛋白去甲基化酶功能研究的课题。之前Kerstin的课题组已经在拟南芥同源蛋白的研究上有了很多重要的发现,在我博士后后期我们在拟南芥中发现了这个蛋白在抗旱中的作用。经过商议,我们将共同合作探讨该蛋白功能在拟南芥和小麦中的进化保守性,我们就后续研究的展开以及成果的分享,归属进行了详细的讨论。
罗达-爱德曼楼 Kerstin Kaufmann教授交谈
简单的午餐过后,我分别与Cezary Smaczniak博士就DAPseq技术进行了深入的沟通和交流。DAPSeq技术是探索转录因子结合靶标的新型技术,可以适合高通量的筛选,对我们未来小麦转录因子功能的探索至关重要。同时和Cezary讨论了在小麦中构建蛋白质IP技术的想法,他是这方面的专家。经过一天的不间断讨论,回到旅馆感冒症状有所缓解,但是嘴巴已经基本不是自己的了。临睡前吃了白加黑并往嘴唇撒了些维生素C粉末,希望能早点好转吧。
2019年8月27日
今天的计划是继续和Kaufmann博士小组的其他成员交流植物转录因子研究的最新策略和调控组的数据分析方法。感谢Kaufmann组的博士生徐晓偲和硕士生李婉莹,两位中国的留学生很体贴的做了PPT,他们对着PPT讲了他们的进展和想法。尤其对于先锋转录因子的功能研究以及利用特异细胞类型分离技术研究转录因子的时空调控研究的详细阐释对我们未来在小麦中从事相关研究有不少启发。下午单独和陈迪俊博士交流了调控组数据分析方法。过去几年,我们合作非常愉快。我们商定未来将更深入的开展合作研究,值得高兴的是,陈迪俊博士已经接受南京大学的邀请,不日将回国开展研究工作,这使得我们未来的合作更加便捷。
与Kaufmann教授课题组研究生交流先锋因子的研究
2019年8月28日
按照计划,接下来三天我们将共同完成一次DAP-Seq实验和一次植物单细胞RNA-Seq的实验。今天一大早,我就来到了实验室,我们利用的是Kaufmann博士和她的合作者共同开发的载体系统来表达蛋白进行DAP-Seq。这个技术的流程已经由Cezary优化,在徐晓偲博士的示范下我们进行了蛋白的表达,IP等步骤。同时,我们也准备了明天将用于单细胞分离的植物组织样品。
Kaufmann教授课题组研究生演示DAP-Seq技术
2019年8月29日
本次访问的另一个重头戏,访问德国国家分子医学中心单细胞生物学平台。单细胞生物学是近年来的热点,对植物学研究而言更是难点。在本人博士后研究的最后阶段,曾经进行过相关的尝试并取得了一些进展。德国国家分子医学中心是欧洲单细胞生物学研究的桥头堡。新近搬到洪堡大学校园内,离Kaufmann教授实验室仅仅相距100米。他们新建了高标准的单细胞生物学平台,对我们未来在华中农大构建单细胞生物学平台具有很高的参考价值。
今天的单细胞实验主要包括样品处理,碾磨,细胞核分离以及细胞核质量评价以及单细胞RNA-Seq的文库构建等步骤,耗时较长,但是最后实验结果相当理想。证明该方法可操作性强。
德国国家分子医学中心单细胞生物学实验室
单细胞分离效果较好
2019年8月30日
今天的主要任务是继续完成之前的DAP-Seq。实验依然是由徐晓偲博士完成,因为我之前已经熟悉了相应的流程,期间外面对细节进行了讨论,尤其是如何构建文库以及测序注意事项等。下午,Cezary特异跑过来跟我聊了更多他做DAP和IP的心得,尤其需要感谢的是他把他改造的载体以及他现在正在撰写的论文文稿也一并送给我了,这大大便利了我未来的工作。下午晚些时候,小组的其他成员知道我将于下周一返回中国,纷纷过来和我告别。幸好我的嘴巴好多了,可以和他们比较轻松的聊天了。有趣的是Kerstin需要早些时候就离开,她约了我周日再来实验室。同事们听了都觉得不可思议,说Kerstin还是对我最看重,她已经很久没有周日加班了。一番寒暄之后,同事们约着下班后到附近的餐馆为我践行,我愉快的答应了。喝了久违的啤酒,不过我还是喝的无酒精的,味道还是不错的。有意思的是当天在CSC资助下的留学生正好抵达,我们也因此有了交集。
2019年8月31日
周六借了迪俊的门卡,还是来到了实验室。今天的任务是来总结一下这几天的实验资料,并将相应的记录保存以便带回国内。另外也将之前和Kaufmann教授实验室的成员讨论所涉及的种子、质粒等打包。下午回到波茨坦,德国之行倒数第二天了。经过忙碌的一周,收获很大。去超市买了些糖果给小朋友,晚上应邀到李志超博士家吃晚饭。吃了一周的面包,终于可以吃到正宗的中国菜了。李志超博士一家也将回国成立自己的课题组,祝未来一切顺利
晚饭后回旅店的上,看到路上随意丢弃的共享脚踏车,不禁想起咱们随意停放的mobike,看来这是一个世界性的问题,人性的问题。
终于吃到中国味的晚餐
随意丢弃路边的共享踏板车
2019年9月1日
因为定酒店和定机票前后相隔太久,大意之下酒店少定了一天,所以今天就得退房。就剩一天了,本着节约的精神去了迪俊家蹭了。将行李放在迪俊家之后按照和Kerstin的约定来到了实验室。等她的过程中将过去几年的实验记录看了一遍,突然意识到不少内容还是挺有价值的。于是,将这些页面一一拍照。上午十点半,Kerstin如约来到实验室。我的感冒经过一个星期基本好了,嘴巴也没有什么影响了。这次我们聊了很多,主要是围绕未来建单细胞生物学平台,共同合作申请中德项目以及共同合作培养研究生以及互访等事宜进行了讨论。临吃饭,Kerstin邀请我去了柏林很有特色的餐馆并在饭后带我参观了一个特别有特色的周末集市。她知道我虽然在柏林波茨坦地区生活了近六年,但是我对这个地方几乎都不熟悉。她给我讲了很多东德的历史,柏林的历史,让我对这个生活工作了几年的城市有了更多的了解。期间,她也和我分享了她对如何当好一个课题组负责人的感受和体会,希望我们能永远记得鼓励自己的学生,她说他们才是未来科学的希望。Kerstin就是这样一个好的科学家,好的朋友和好的导师。
德国周末集市上的手工童鞋
2019年9月2日
终于到了离开的一天,有些期待回家也有些不舍德国的朋友们。昨天晚上,朋友们带着各种礼物来跟我告别,还得我的行李严重超标。感动之余带着满满的收获踏上了回家的路。很有意思的是,柏林飞巴黎的航班又一次晚点。我不得不在巴黎机场一路狂奔,最后侥幸赶上飞机,意外的还把舱位升了一级,属于比较宽松的经济舱。这次我吸取了教训,一路上外套、毯子都用上了,总算是平安到达家乡。不过,因为前一程的晚点,我的行李不出意外的又一次延误了,好在并没有拖延太久。
感触:德国我呆了快六年,这一次回去一切都轻车熟路。和Kerstin Kaufmann教授的交流很愉快,也很有成效,未来的合作空间很大,他们对科研细节的把握和原创性科研的执着让人钦佩。生活上不存在适应对我问题,但是没有移动支付,周日所有商店都关门让我还是感觉到了不适应。另外,不得不说一下泰戈尔机场。泰戈尔机场是柏林的老机场,很小,原本应该在2012年就退出历史舞台,却因代替它的所内菲尔德机场各种匪夷所思的问题迟迟无法竣工而被迫依然在服役。这件事几乎是德国人的心病了,更是德国严谨,工业化的最大讽刺。相比于德国,中国的活力和快节奏使得我们的国家更有生机,未来我们需要向德国学习他们成熟的研究体系以为国家的长久发展提供更坚实的科技引擎。
鄢文豪 2019.09.22